关卡、宝藏和仙灵，这三种秘境玩法在天子手游里是不同的体验，虽然同属秘境玩法但所获奖励也各有不同。玩家可以按照当前自己所需的资源类型，来选择优先要进入的挑战玩法。不过这几个秘境地图是需要在不同等级时期才能开启的，关卡秘境最早在15级就可以闯关，而宝藏秘境和仙灵秘境则分别要达到24和30级。

在关卡秘境中玩家需要完成不同地形的挑战，最终闯过沿路拦截的小怪并杀死秘境首领，即可完成当前关卡的挑战。这种挑战系统会在每时段给予大家5次挑战次数，在当日18点和24点次数会被重置，所以大家一定要适时的进行挑战。秘境关卡里只有完成前置通关关卡，才能成功解锁下一关卡秘境，同时开启秘境还存在等级上的要求。在这场挑战中第一次得到三星可以获得宝箱，进入高等级秘境成功三星时还能得到器魂，当前关卡在成功3星之后可以为下次扫荡提供机会。

宝藏秘境中宝箱的存在就是大家需要追寻的目标，在这些宝箱中蕴含大量惊喜物品，但同时你也要面对精英怪物和首领的挑战。这种场合里杀死的小怪数量达到要求，首领才会出现来应战，每个时间段里你可以有2次机会挑战宝藏秘境。而仙灵秘境是30级的时候开启的玩法，这是三个秘境玩法中最后一个激活的。在其中完成通关，你所获得的仙灵丹、仙灵进阶和升星材料，就可以为提升仙灵能力而做好准备。